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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Algodão. |
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Data corrente: |
20/02/2017 |
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Data da última atualização: |
20/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
SOARES, T. da C.; LIMA, L. M. de; SILVA, C. R. C. da; SANTOS, I. L. V. de L.; CARVALHO, J. M. F. C.; MELO FILHO, P. de A.; SANTOS, R. C. dos. |
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Afiliação: |
TAIZA DA CUNHA SOARES, RENORBIO/UFRPE; LIZIANE MARIA DE LIMA, CNPA; CARLIANE REBCA COELHO DA SILVA, ENORBIO/UFRPE; IGOR LUIZ VIEIRA DE LIMA SANTOS, UFCG; JULITA MARIA FROTA CHAGAS CARVALHO, CNPA; PÉRICLES DE ALBUQUERQUE MELO FILHO, UFRPE; ROSEANE CAVALCANTI DOS SANTOS, CNPA. |
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Título: |
Análise in sílico da homologia do gene Serk em Gossypium hirsutum L. e espécies correlatas. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: ENCONTRO DE GENÉTICA DO NORDESTE, 21., 2016, Recife. Anais... Ribeirão Preto: SBG; Recife: UFPE: UFRPE: UPE, 2016. p. 55. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Nesse trabalho procedeu-se a uma análise in silico buscando homologia do SERK entre acessos de G. hirsutumL. e outras espécies relacionadas, com sequências depositadas em banco de genes (www.ncbi.nlm.nih.gov). As espécies selecionadas foram: G. hirsutum, Theobroma cacao, Citrus sinensis, Vitis vinifera, Glycine max e Phaseolus vulgaris. Sequências completas do gene (mRNA) foram alinhadas por meio do programa ClustalX (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) para estimativa da similaridade gênica. A seguir, procedeu-se análise da proteína codificante pela ferramenta Blastx, do NCBI. Verificou-se que o gene SERK1 possui poucas regiões conservadas entre as espécies, contudo, foi observada homologia entre as sequências de G. hirsutum e Theobroma cacao com maior identidade na ordem de 86% e bit-score 681. Essa mesma relação (93%) foi observada entre as sequências de Phaseolus vulgaris e Glycine max com bit-score no valor de 1036, o que é esperado por se tratar de duas leguminosas, hermafroditas e cleistogâmicas. A espécie mais distante evolutivamente entre as demais foi aVitis vinífera. Baseando-se na análise dos aminoácidos, verificou-se alto grau de conservação dos principais domínios catalíticos. A proteína SERK possui domínio catalítico da serina/ treonina-kinase e pertence a uma subfamília envolvida em várias vias de sinalização, entre elas a restrição de proliferação de células em início de diferenciação. |
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Thesagro: |
Citrus Sinensis; Embriogênese; Theobroma Cacao. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/156153/1/Analise-in-silico.pdf
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Marc: |
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520 $aNesse trabalho procedeu-se a uma análise in silico buscando homologia do SERK entre acessos de G. hirsutumL. e outras espécies relacionadas, com sequências depositadas em banco de genes (www.ncbi.nlm.nih.gov). As espécies selecionadas foram: G. hirsutum, Theobroma cacao, Citrus sinensis, Vitis vinifera, Glycine max e Phaseolus vulgaris. Sequências completas do gene (mRNA) foram alinhadas por meio do programa ClustalX (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2) para estimativa da similaridade gênica. A seguir, procedeu-se análise da proteína codificante pela ferramenta Blastx, do NCBI. Verificou-se que o gene SERK1 possui poucas regiões conservadas entre as espécies, contudo, foi observada homologia entre as sequências de G. hirsutum e Theobroma cacao com maior identidade na ordem de 86% e bit-score 681. Essa mesma relação (93%) foi observada entre as sequências de Phaseolus vulgaris e Glycine max com bit-score no valor de 1036, o que é esperado por se tratar de duas leguminosas, hermafroditas e cleistogâmicas. A espécie mais distante evolutivamente entre as demais foi aVitis vinífera. Baseando-se na análise dos aminoácidos, verificou-se alto grau de conservação dos principais domínios catalíticos. A proteína SERK possui domínio catalítico da serina/ treonina-kinase e pertence a uma subfamília envolvida em várias vias de sinalização, entre elas a restrição de proliferação de células em início de diferenciação.
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Registro original: |
Embrapa Algodão (CNPA) |
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